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在苹果手机上区分主号副号收到的短信，可以通过以下方法。
1、双卡双待手机在接收短信时，会根据短信内容标注主卡或副卡的发送信息，短信内容里显示的号码前有“主/副”字样，即可知道是主号还是副号接收的短信。
2、部分定制类业务会按照用户定制的业务对应的主副卡分别发送短信和接收短信，用户可以凭此区分是主卡还是副卡接收的短信。
3、若无法直接区分，可以联系运营商客服或携带机主身份证原件到附近的运营商营业厅咨询，以工作人员的实际解答为准，另外也可以登录运营商APP，通过查询页面来查看短信是从哪个号码上收到的。
方法仅供参考，不同版本的iOS系统和运营商设置可能存在差异，如有疑问，建议直接联系手机运营商客服进行咨询。